Gmina Dubeninki położona w powiecie gołdapskim, jest najbardziej wysuniętą na północny wschód gminą województwa warmińsko – mazurskiego.

Od strony zachodniej graniczy z gminą Gołdap, zaś od południa i wschodu z trzema gminami należącymi do powiatu suwalskiego, województwa podlaskiego. Gminami tymi są kolejno: Filipów, Przerośl i Wiżajny.

Północna granica gminy Dubeninki pokrywa się z 20-kilometrowym odcinkiem granicy polsko-rosyjskiej (Obwodem Kaliningradzkim). Przy wschodnim krańcu tego odcinka znajduje się tzw. trójstyk czyli miejsce, gdzie spotykają się granice trzech państw – Polski, Rosji i Litwy.